参考文献是医学论文的重要组成部分，国内医学期刊一般根据国家标准GB/T 7714-2015在稿约中明确约定了文后参考文献的著录格式，如“期刊：[序号]作者名．文题[J]．期刊名，年，卷(期)：起页-止页．书籍：[序号]作者名．书名[M]．版次．出版地：出版单位，年：起页-止页．”每条文献的著录项目应齐全。但是，医刊汇编译在工作实践中发现，很多作者的论文中参考文献格式著录不齐全或不正确，具体主要表现以下几个方面：
一、作者姓名引用错误。考文献著录的第一项即为作者名。按照标准，被引用文献作者不足3人者，需将作者名全部列出。超过3人时，只列前3人后加等(中文)、et al(英文)。作者在参考文献著录时，容易出现作者名著录不全或过多的情况。也有不少作者将欧美等西方国家的作者姓名写错，欧美作者在论文中的署名均采用“名前姓后”，在作为参考文献著录时，国内采用的是“姓前名后，姓用全称，名用缩写”。同时，还有作者将学位的缩写误认为是作者姓名的一部分；另外，某些国家人名有复姓和姓氏的前缀，也容易出错。
二、文章题名引用错误。献库收录时，由于文字处理程序的特殊要求，有些书写格式与印刷版不同，部分作者在著录参考文献文题时直接照搬，导致文章题名引用错误。另外，外文文章篇名有时包含两个甚至三个句子，引用者需著录完整篇名，但有些作者在著录时常将文章篇名的分句漏掉。还有一种比较常见的情况是，在转录外文文题时，一个完整的单词被空格分成两个单词，或者两个单词漏掉了空格而合并为一个单词。这种情况可以通过作者对文题进行认真的核对而避免。
三、期刊名书写错误。据国家标准GB/T 7714-2015，外文期刊刊名采用缩写形式。医学期刊名称的缩写，一般是去掉实词的词尾，略去虚词(连词、介词、冠词)，每个单词的首字母大写。书写时还需注意的是：单个词构成的刊名不缩写；国际通用的以首字母组合构成的刊名应全部大写；不同出版地出版的相同刊名的期刊，刊名缩写应相同，在刊名缩写的后面加注出片眨地；国家(地区)名称的缩写，有特定的形式，不能简单地用截短法略去词尾的两三个字母。中文期刊刊名的著录相对外文期刊刊名出现问题较少，但也有作者误写刊名，应引起注意。
四、版次著录错误。版次是图书排版的次数，用来表明图书版本的重要变更情况。参考文献中图书的著录项目也包括了所引用研究结果或观点所在的具体页码，但这一具体页码在同一图书不同版次里可能是不一致的，甚至所引用的研究结果或观点在这个版次的书上有，而在另外一个版次的书上未提及，因此，作者在著录参考文献时，必须明确图书的具体版次。根据国家标准GB/T 7714-2015，版次的著录采用阿拉伯数字、序号缩略形式或其他标志标示，第1版不著录。
五、年、卷、期、起止页码信息不全或信息错误。出现这类问题往往由以下原因引起：一是直接抄录文献库检索结果，但有些文献库检索结果列表中只有题名、来源和年期，没有具体的卷次、起止页码，如果作者没有下载阅读全文，而是直接抄录检索结果，就会导致信息著录不全；二是二手转引，如果他人著录参考文献有误，而作者没有查对原始文献，就会出现差错，甚至以讹传讹，这是非常不应该的；三是不了解各个期刊的具体情况，出现将期数误写为卷次，或将卷次误写为期数的情况。另外，也有作者在著录电子出版物页码时错误地省略了“e”。
